Еще в 1992 году Румынская православная церковь восстановила собственную Бессарабскую митрополию на территории Молдовы. РПЦ, понятно, расценила этот ша как недоброжелательный.
Конфликт обострился в конце октября 2007 года, когда Синод РумПЦ принял решение о создании в составе Румынского патриархата семи новых епископатов. Вскоре после этого глава Бессарабской митрополии митрополит Петр (Пэдурару) заявил, что Румынский патриархат намерен расширять свое влияние в том числе и в Украине. За этим последовала гневная реакция митрополита Кирилла (нынешнего патриарха) и Синода УПЦ.
А в январе 2008 года в конфликт вмешались власти Молдовы. В итоге Румынский патриархат даже жаловался на тогдашнего президента Владимира Воронина в Совет Европы.