Известность Чеботареву принес фильм «Человек-амфибия», снятый в 1961 году. Картину посмотрели свыше 70 миллионов зрителей.
Творческая биография режиссера насчитывает более полутора десятков фильмов. Он работал над такими картинами, как «Батальоны просят огня», «Как вас теперь называть?» и «Дикий мед», посвященные Великой Отечественной войне, а также детективы "»Неизвестные страницы из жизни разведчика», «Тревожный вылет» и «Выстрел в спину».
Чеботарев прошел всю войну в артиллерии, а после демобилизации поступил в ВГИК на курс Михаила Ромма.
Режиссеру было присвоено звание заслуженного деятеля искусств России, он награжден орденом Почета.