На следующем этапе премии Большое жюри, состоящее из профессиональных литературных критиков, литературоведов и писателей, рецензирует и оценивает выдвинутые произведения. Книги, набравшие наибольшее число баллов, образуют шорт-лист.
После этого Малое жюри, состоящее уже не столько из профессиональных писателей, сколько из просвещенных читателей, авторитетных деятелей искусства, политики и бизнеса, на основании шорт-листа путем открытого голосования определяет победителя.
Примечание: На премию могут быть выдвинуты прозаические произведения, впервые опубликованные на русском языке в России в течение прошедшего календарного года. Девиз премии: «Проснуться знаменитым». В 2011 году премия Национальный бестселлер отмечает свое десятилетие.
Отметим также, что победителем в данной номинации в 2010 году Эдуард Кочергин и его книга "Крещенные крестами: записки на коленках".
В 2009 году премию получил Андрей Геласимов за роман «Степные боги».