Народився 2 травня 1975, Кривий Ріг, Дніпропетровська область. Друг дитинства Володимира Зеленського. Вчилися, а потім і працювали разом над різними проєктами, зокрема Студії Квартал-95.
Закінчив Київський національний економічний університет імені Вадима Гетьмана (1997) і Академію праці і соціальних відносин і туризму (2006), спеціальність — «Суд, адвокатура і прокуратура».
Дружина — Оксана Лазаренко, громадянка РФ із посвідкою на постійне проживання в Україні, сини — Артур, Степан.
З 25 січня 2013 року був керівником ТОВ «Квартал 95», з 27 грудня 2013 — керівником ТОВ «Студія Квартал-95».
На ім'я Івана Баканова зареєстровані компанії ТОВ "Студія Квартал-95" і ТОВ "Квартал-95". Їх засновник і кінцевий бенефіціар - "Грін Фемілі" Лтд (Green Family Ltd) - зареєстрований на Кіпрі, в Нікосії. Там вказані два керівника - Оксана Лазаренко (дружина Івана Баканова) і Марина Разомова-Георгіу.
С 2 грудня 2017 по 27 травня 2019 року - голова партії Слуга народу.
У президентській передвиборчій кампанії 2019 Іван Баканов - глава передвиборчого штабу кандидата в президенти України Володимира Зеленського.
22 травня 2019 року Івана Баканов призначений першим заступником голови Служби безпеки України та начальником Головного управління по боротьбі з корупцією та організованою злочинністю Центрального управління СБУ.
28 травня 2019 року призначений членом РНБО України. 29 травня 2019 року призначений тимчасово виконуючим обов'язки голови СБУ.
За кілька днів до призначення отримав звання лейтенанта.
З 3 червня 2019, на час відпустки Василя Грицака, тимчасово виконуючий обов'язки глави СБУ.
29 серпня 2019 року на першому засіданні Верховної Ради України lX скликання було затверджено в якості Голови Служби Безпеки України (СБУ).
17 липня 2022 року президент Володимир Зеленський усунув Івана Баканова з посади голови Служби безпеки України.
Верховна Рада на засіданні 19 липня 2022 року відправила у відставку усуненого від посади голову СБУ Івана Баканова.
19.07.2022