Народилася 21 червня 1973 року, м. Братислава.
1996 року закінчила юридичний факультет Університету Коменського в Братиславі.
Чапутова була заступником голови адміністрації міста Пезинок, упродовж багатьох років працювала у цивільному об'єднанні VIA IURIS. У 2016 році вона здобула екологічну премію Goldman.
Зузана Чапутова – адвокат із міста Пезинок, засновник та голова непарламентської ліберальної партії "Прогресивна Словаччина". Вона виступає за "справедливість для всіх", гідність громадян похилого віку, право на аборт, захист ЛГБТ-спільноти та навколишнього середовища.
З 2017 року Зузана Чапутова є одним із засновників та заступником голови соціал-ліберальної партії Прогресивна Словаччина.
У березні 2018 року Чапутова оголосила про свій намір балотуватись на президентських виборах у 2019 році. Її кандидатуру підтримали дві інші партії, SaS та SPOLU.
На президентських виборах 2019 отримала 58,41 % голосів виборців, перемігши в другому турі Мароша Шефчовича, який набрав 41,59 % голосів. Стала п'ятим словацьким президентом і першою жінкою-президентом в історії Словаччини.
Розлучена, має двох дочок.
16.07.2019