Народився 4 грудня 1952 року у селі Охиньки Прилуцького району на Чернігівщині.
Після школи відучився у районному педучилищі. 1977 року закінчив історичний факультет Київського держуніверситету ім.Т.Шевченка, а 1998-го там же - юрфак за спеціальністю правознавство.
1976–1977 — учитель історії та географії Калинівської 8-річної школи Городищенського району Черкаської області.
1977–1986 — в Ленінградському райкомі ЛКСМУ і Ленінградському райкомі КПУ Києва.
1986–1990 — заступник голови, перший заступник голови, з 1990 — голова виконкому Ленінградської райради народних депутатів Києва.
1991–1992 — начальник управління, заступник голови КМДА.
1992–1996 — начальник відділу маркетингу «Київнафтопродукт».
Березень — липень 1996 — заступник міністра — керівник справами Міністерства юстиції України.
1994–1998 — народний депутат Верховної Ради України 2-го скликання. Член депутатської групи «Реформи».
1998–2002 — народний депутат Верховної Ради України 3-го скликання. Член групи «Незалежні», член фракції ПРП «Реформи-центр».
2002–2005 — Член фракції «Наша Україна», уповноважений представник партії «Реформи і порядок».
2002–2006 — народний депутат Верховної Ради України 4-го скликання. Висунутий від блоку Віктора Ющенка Наша Україна.
2007–2012 — народний депутат Верховної Ради України 6-го скликання. Член фракції «БЮТ».
2012–2014 — народний депутат Верховної Ради України 7-го скликання. Член фракції Всеукраїнського об'єднання «Батьківщина».
7 березня 2014 року призначений головою Київської міськдержадміністрації. Балотувався на посаду міського голови міста Києва і, одночасно, до міської ради, очолюючи список Київської міської організації політичної партії "Всеукраїнське об'єднання «Батьківщина».
13 травня 2014 року Верховна Рада України достроково припинила повноваження народного депутата України Бондаренка у зв'язку з особистою заявою про складення ним депутатських повноважень.
10 червня 2014 року подав у відставку з посади голови КМДА. 25 червня указом Президента України Петра Порошенка звільнений з цієї посади. Наступником Бондаренка на посаді став мера Києва Віталій Кличко.
Бондаренко – голова правління благодійного фонду Рідна оселя, президент громадської організації "Фестиваль "Київська Русь".
Політик одружений, виховав двох доньок.
У вільний час захоплюється садівництвом-городництвом, бджільництвом, народною творчістю.
Володимир Бондаренко помер 24 серпня 2021 року на 69-му році життя.
27.02.2023