Народився 21 лютого 1953 року у Черкасах.
У 1975 р. закінчив факультет міжнародних відносин та міжнародного права Київського державного університету ім.Шевченка. Окрім української, володіє російською, англійською, французькою мовами.
У 1975-1976 pp. - перекладач на будівництві металургійного заводу у м. Карачі, Пакистан.
1976-1979 рр. - аташе, третій секретар відділу печатки МЗС УРСР.
1979-1983 р.р. - аташе Постійного представництва УРСР при ООН.
1983-1985 р.р. - другий секретар відділу друку; другий секретар відділу міжнародних організацій МЗС УРСР.
1985-1988 рр. – перший секретар Генерального секретаріату, перший секретар відділу головного радника МЗС УРСР.
1988-1992 рр. - Перший секретар Постійного представництва СРСР при ООН.
1992-1994 рр. – радник, заступник постійного представника України при ООН, в.о. Постійного представника України при ООН.
1994-1995 р.р. – начальник Управління міжнародних організацій МЗС України.
1995-1998 рр. – заступник міністра закордонних справ України, голова Національної комісії України у справах ЮНЕСКО.
1996-1998 рр. – представник України у виконавчій раді ЮНЕСКО.
1998-2000 рр. - надзвичайний та повноважний посол України в Канаді, представник України при Міжнародній організації цивільної авіації.
2000-2003 р.р. - надзвичайний та повноважний посол України у Королівстві Нідерланди, постійний представник України при Організації із заборони хімічної зброї.
2000-2005 рр. - надзвичайний та повноважний посол України у Королівстві Бельгія, у Великому Герцогстві Люксембург, голова місії України при НАТО за сумісництвом.
2005-2006 рр. – директор департаменту НАТО Міністерства закордонних справ України.
2006-2007 рр. – заступник міністра закордонних справ України.
2007-2010 рр. – перший заступник міністра закордонних справ України.
З березня до жовтня 2009 р. - виконував обов'язки міністра закордонних справ України.
З липня 2010 р. – надзвичайний та повноважний посол України у Сполученому Королівстві Великої Британії та Північної Ірландії.
З серпня 2010 р. – постійний представник України при Міжнародній морській організації (ІМО) за сумісництвом.
У травні 2014 р. указом в.о. президента України Олександра Турчинова звільнено з посади посла у Великій Британії та представника України в ІМО.
У травні 2015 р. обраний президентом Української асоціації зовнішньої політики, співзасновником якої є.
Володимир Хандогій одружений. Його дружина — Наталя Борисівна Шевченко. У пари двоє дітей: дочка і син.
13.06.2016