Народився 5 жовтня 1952 року у селищі Дангар Кулябської області.
1982 року закінчив заочне відділення Таджицького держуніверситету за спеціальністю економіст.
Трудову діяльність розпочав у 1969 році електриком маслозаводу у місті Курган-Тюбе. У 1971-1974 pp. служив у радянській армії, службу проходив на Тихоокеанському флоті.
У 1976-1982 pp. – секретар правління, голова профкому у колгоспі ім.Леніна Дангаринського району Кулябської області.
У 1982-1988 роках. – на звільненій партійній роботі (інструктор райкому, секретар парткому радгоспу).
У 1987-1992 pp. – директор радгоспу ім.Леніна Дангаринського району Кулябської області.
У 1990 р. Рахмона обрано народним депутатом Верховної ради Таджикистану XII скликання.
Восени 1992 року призначений головою виконавчого комітету Ради народних депутатів Кулябської області.
У 1992-1994 pp. – голова Верховної ради Таджикистану.
6 листопада 1994-го обраний президентом Республіки Таджикистан.
6 листопада 1999 року переобраний президентом на другий, уже семирічний термін.
6 листопада 2006-го переобрано на третій президентський термін.
6 листопада 2013 р. на чергових виборах президента республіки Таджикистан Рахмона переобрано вчетверте.
У Таджикистані є масштабний культ особистості президента Емомалі Рахмона. У грудні 2015 року Емомалі Рахмон підписав запропонований парламентом республіки закон Республіки Таджикистан "Про Засновника миру та національної єдності - лідера нації", і йому було присвоєно офіційний титул "Засновник миру та національної єдності - лідер нації".
22 травня 2016 року, за результатами всенародного конституційного референдуму, прийняті поправки, що зняли обмеження щодо кількості переобрань на пост президента Таджикистану і знижують віковий ценз для тих, хто балотується на пост президента з 35 до 30 років.
2020 року на виборах вп'яте переобраний президентом країни, згідно офіційних даних, за Рахмона проголосував 91% виборців.
Емомалі Рахмон одружений. Має дев'ятьох дітей.
До квітня 2007 носив прізвище Рахмонов. Тоді ж закликав усіх громадян республіки відмовитися від слов'янських закінчень своїх прізвищ, а також доручив органам реєстрації записувати прізвища новонароджених відповідно до перської традиції.
07.09.2022